CIP在環(huán)境中持續(xù)地遷移擴(kuò)散, 當(dāng)達(dá)到一定濃度后會對某些敏感微生物的生長產(chǎn)生抑制, 甚至直接殺死它們, 從而改變土著微生物區(qū)系和數(shù)量, 影響微生物群落結(jié)構(gòu)分布.同時, 環(huán)境中殘留的CIP等氟喹諾酮類抗生素能促進(jìn)抗性基因的產(chǎn)生.目前, 在河流、湖泊、土壤、底泥等不同介質(zhì)中就檢出了由于抗生素作用而產(chǎn)生的抗性基因和耐藥細(xì)菌.抗性基因的傳播和擴(kuò)散可能會加快抗藥性菌群的大量繁殖, 且細(xì)菌抗藥性一旦生成就很難在短時間內(nèi)消失， 對微生物群落結(jié)構(gòu)形成了潛在的威脅.抗性基因作為一種新型污染物, 其危害比抗生素本身要大, 這給人類的身體健康和生態(tài)環(huán)境安全帶來了不可預(yù)測的風(fēng)險.近年來, 圍繞著CIP對水或土壤中微生物群落的影響開展了較多的研究, 但大多集中于CIP痕量水平, 關(guān)于高濃度CIP對活性污泥中微生物群落結(jié)構(gòu)、功能微生物數(shù)量及抗性基因豐度的影響還少有報道.
Xie等針對某抗生素生產(chǎn)廢水開展研究, 發(fā)現(xiàn)廢水中CIP濃度很高, 達(dá)到5.06 mg ?L-1, 生化處理對CIP去除效果不佳, 處理出水中殘留濃度仍高達(dá)3.23 mg ?L-1; 且該系統(tǒng)對有機物和氨氮去除效果較差, 推測是廢水中的CIP對活性污泥中功能微生物造成了影響.此外, 本實驗室前期研究也發(fā)現(xiàn)CIP對膜生物反應(yīng)器運行效能會產(chǎn)生負(fù)面影響.
本研究旨在通過MBR處理CIP模擬廢水實驗, 考察不同CIP投加濃度下MBR中微生物群落結(jié)構(gòu)和功能微生物豐度的變化; 探討CIP-ARGs, 包括(bāo kuò)gyr
A、gyr
B、parC和parE在CIP選擇壓力下的變化情況, 以期為CIP生產(chǎn)廢水的無害化處理提供數(shù)據(jù)支撐.
1 材料與方法1.1 實驗用水
MBR進(jìn)水中含有200 mg ?L-1葡萄糖、256.67 mg ?L-1無水乙酸鈉(Sodium)、94.17 mg ?L-1硫酸銨和17.50 mg ?L-1磷酸二氫鉀, 其CO
D、氨氮和磷(P)濃度分別約為400、20和4 mg ?L-1.整個實驗分為4個工況, 共運行132 d, 運行工況1、2、3、4條件下分別向上述MBR進(jìn)水中投加CIP濃度為0、5、10和15 mg ?L-1.所用CI
P、葡萄糖、無水乙酸鈉、硫酸銨、磷酸二氫鉀等藥劑均為分析純.
1.2 實驗裝置與運行條件
MBR主要由有機玻璃容器、膜組件和曝氣裝置組成.反應(yīng)器中接種污泥取自某生活污水處理廠好氧膜池, 經(jīng)稀釋水洗和稀釋后, 調(diào)整反應(yīng)器中初始MLSS為6.2 g ?L-1.整個MBR裝置和進(jìn)水桶采取遮光處理, 避免CIP發(fā)生光解.反應(yīng)器連續(xù)進(jìn)水, 流速為25 mL ?min-1; 間歇抽吸出水, 每連續(xù)出水5 min后停止出水1 min, 以減緩膜污染, 出水流速為30 mL ?min-1.整個實驗中, 反應(yīng)器水力停留時間為8 h, 溶解氧為2~4 mg ?L-1, pH為7~8, 水溫為25~30℃, COD容積負(fù)荷約1.2 kg ?-1, 除工況1視情況(Condition)周期性排泥外其余3個工況幾乎沒有排泥.
圖 1
圖 1 實驗裝置結(jié)構(gòu)示意
每個工況下周期性取樣分析常規(guī)水質(zhì)指標(biāo)和CIP的變化情況, 并取污泥樣品密封避光保存于-70℃超低溫冰箱內(nèi), 用于分析微生物群落及其抗性基因的變化.
1.3 分析項目與方法1.3.1 高通量測序
分別于第33
D、36 d和66
D、69 d和99
D、102 d和132 d采取污泥樣品, 委托生工生物工程股份有限公司進(jìn)行高通量測序.
泥水混合物3 000 r ?min-1離心去上清液, 沉淀（precipitation）固體部分使用E.Z.N.ATM Mag-Bind Soil DNA Kit試劑盒進(jìn)行DNA提取, 之后用Qubit®2.0熒光計檢測DNA濃度, 用瓊脂糖凝膠檢測DNA完整性, 用Qubit 2.0 DNA檢測試劑盒對基因組DNA精確定量.PCR擴(kuò)增采用融合了MiSeq測序平臺的V3-V4通用引物341F CCTACGGGNGGCWGCAG)和805R.
1.3.2 抗性基因檢測分析
采用PowerSoil® DNA Isolation Kit試劑盒并結(jié)合液氮冷凍研磨法對樣品的基因組DNA進(jìn)行提取.PCR的擴(kuò)增引物如表 1所示.PCR反應(yīng)體系:DNA模板1 μL, 2×Taq酶12.5 μL, 上下游引物各0.5 μL, 10.5 μL ddH2O, 反應(yīng)體系總體積為25 μL.PCR反應(yīng)程序:94℃預(yù)熱5 min, 30個循環(huán):94℃變性30 s, 退火溫度30 s, 72℃延伸30 s, 最后72℃停留7 min.再采用Universal DNA Purification Kit試劑盒對CIP-ARGs的PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化回收, 并委托中國科學(xué)院南京土壤研究所對純化的PCR產(chǎn)物進(jìn)行定量分析.
表 1 引物信息 Table 1 Primer information
1.3.3 其它指標(biāo)（target aim)檢測
CIP濃度采用高效液相色譜儀HPLC測定:色譜柱為ODS-2, 5 μm 4.6×250 mm; 檢測器為紫外可見吸收檢測器, 波長為277 nm; 流動相為色譜純乙腈:水=20 :80; 流速為0.7 mL ?min-1; 溫度為35℃; 進(jìn)樣體積為10 μL.CO
D、氨氮和MLSS分別采用重鉻酸鉀法、納氏試劑分光光度法和重量法[30]測定; TOC采用TOC-VCSN總有機碳分析儀測定.
2 結(jié)果與討論2.1 不同CIP投加濃度下MBR中微生物群落解析2.1.1 活性污泥的微生物群落結(jié)構(gòu)
不同CIP投加濃度下MBR污泥中微生物群落在門、綱、目、科、屬等分類水平上的平均種類分布如圖 2所示.門、綱、目、科、屬等5個分類水平微生物種類數(shù)分布大體上都隨著CIP投加濃度和運行時間的增加呈現(xiàn)減少的趨勢.
圖 2
圖 2 各分類水平微生物群落的數(shù)量分布
在工況1下MBR運行穩(wěn)定時, 微生物群落分析中共檢出了17個門、34個綱、60個目、104個科和232個屬.
當(dāng)運行至工況2, MBR進(jìn)水中CIP濃度為5 mg ?L-1時, 微生物體系突然受到CIP的脅迫, 敏感微生物活性受到抑制而死亡, 使得微生物群落的門、綱和目種類減少; 繼續(xù)運行至該階段末, MBR運行逐漸趨于穩(wěn)定, 此時科和屬種類數(shù)相較于0 mg ?L-1時分別下降了21%和25%.
繼續(xù)增加MBR進(jìn)水中CIP濃度至10 mg ?L-1和15 mg ?L-1, 門和綱水平上微生物種類數(shù)基本趨于穩(wěn)定; 但目、科、屬水平上微生物種類數(shù)卻有較大程度減少, 尤其是屬水平, 工況4末的屬水平種類數(shù)相較于工況1末下降了53%.結(jié)果顯示, CIP的加入對微生物群落的門和綱數(shù)量影響不大, 但對目、科、屬數(shù)量影響較大; 表明了微生物分類單位越小, CIP脅迫所引起的微生物種類變化越明顯.
為了深入探究不同CIP濃度對微生物群落結(jié)構(gòu)的影響, 接下來分別從門、科、屬水平上進(jìn)行群落結(jié)構(gòu)分析.門水平上, MBR中微生物群落結(jié)構(gòu)分布如圖 3所示.
圖 3
圖 3 門水平上微生物群落結(jié)構(gòu)分布
MBR在工況1中運行穩(wěn)定時, 微生物群落共檢出17個門, 優(yōu)勢菌群為變形菌門、擬桿菌門、浮霉菌門、酸桿菌門和硝化螺旋菌門, 其中變形菌門所占豐度比例最大, 為52%.工況2, MBR進(jìn)水中開始投加5 mg ?L-1的CIP, 上述優(yōu)勢菌群受到CIP的突然沖擊, 其相對豐度比例呈現(xiàn)出不同程度地降低; 厚壁菌門、放線菌門、Candidatus Saccharibacteria和綠彎菌門為該工況下新增的優(yōu)勢菌群.
隨著運行時間的延長和CIP投加濃度的繼續(xù)增加, 上述優(yōu)勢菌群的相對豐度比例呈現(xiàn)不同的變化趨勢:變形菌門和擬桿菌門的相對豐度比例呈先升高后降低再升高再降低的趨勢, 表明這兩種菌群對CIP濃度的增加比較敏感; 浮霉菌門、酸桿菌門和硝化螺旋菌門的相對豐度比例均呈先增后減的趨勢, 表明這3種菌群能適應(yīng)一定濃度的CIP環(huán)境但在更高濃度的CIP環(huán)境中很難生存; 5 mg ?L-1時新檢出的優(yōu)勢菌群均不能適應(yīng)CIP的長期脅迫而持續(xù)減少, 甚至消失.
在高濃度CIP的長期選擇性壓力下變形菌門和擬桿菌門成為MBR污泥中的主要菌群, 工況4末二者相對豐度比例分別為57.5%和12.7%, 表明MBR中大部分抗CIP的微生物是屬于這兩種優(yōu)勢菌群, 這與前人的研究一致.
科水平上, MBR中微生物群落結(jié)構(gòu)分布如圖 4所示.
圖 4
圖 4 科水平上微生物群落結(jié)構(gòu)分布
工況1條件下, MBR中檢出的優(yōu)勢菌科有紅環(huán)菌科、Kofleriacea
E、生絲微菌科、Chitinophagaceae和浮霉菌科, 所占比例分別為15.45%、5.80%、5.67%、16.10%和10.13%;前3者均屬于變形菌門, 后兩者分別隸屬于擬桿菌門和浮霉菌門.工況2, 當(dāng)MBR進(jìn)水中開始投加CIP時, 這些優(yōu)勢菌科活性和生長受到CIP的抑制, 相對豐度比例均急劇降低; 而紅桿菌科、消化鏈球菌科和葉桿菌科比例增大, 成為優(yōu)勢菌科.
當(dāng)MBR在5~15 mg ?L-1的CIP環(huán)境中運行期間, 微生物群落結(jié)構(gòu)產(chǎn)生不同的變化.其中紅環(huán)菌科逐漸適應(yīng)CIP環(huán)境, 相對豐度比例持續(xù)增加; Kofleriacea
E、Chitinophagaceae和浮霉菌科的相對豐度比例呈現(xiàn)出先升高后降低再升高再降低的過程, 表現(xiàn)出波動狀態(tài), 表明這3種菌科易受到CIP濃度增加的影響, 其中Chitinophagaceae的變化趨勢與擬桿菌門完全一致; 生絲微菌科、紅桿菌科、消化鏈球菌科和葉桿菌科相對豐度比例逐漸降低, 表明這4種菌科經(jīng)不住CIP的長期脅迫.
面對高濃度CIP長時間的選擇性壓力, 在工況4末期選擇出來的優(yōu)勢菌科為紅環(huán)菌科、Chitinophagaceae和叢毛單胞菌科, 相對豐度比例分別為29.96%、5.44%和6.60%.
屬水平上, MBR中微生物群落結(jié)構(gòu)分布如圖 5所示.MBR進(jìn)水中未投加CIP時, 污泥中的優(yōu)勢菌（fungus)屬為Azospir
A、Kofleri
A、Ferruginibacte
R、動膠菌屬和生絲微菌屬, 所占比例分別為13.07%、5.80%、10.41%、7.03%和4.48%.工況2, 當(dāng)MBR進(jìn)水中開始投加CIP時, 上述優(yōu)勢菌屬相對豐度比例均急劇降低, 表明其活性和生長受到了CIP的抑制; 此時優(yōu)勢菌屬為動膠菌屬、Tissierell
A、Acetoanaerobium和Roseicitreum.
圖 5
圖 5 屬水平上微生物群落結(jié)構(gòu)分布
由圖 5可知, 繼續(xù)延長CIP作用時間并增加CIP的投加濃度, 微生物群落結(jié)構(gòu)分布產(chǎn)生顯著（striking）性差異.其中Azospir
A、Kofleri
A、Tissierell
A、生絲微菌屬、Acetoanaerobium和Roseicitreum在CIP長期脅迫下很難生存而失去優(yōu)勢; 而Methyloversatili
S、Ferruginibacte
R、動膠菌屬和叢毛單胞菌屬在高濃度CIP的選擇性壓力下成為優(yōu)勢菌屬, 工況4末各相對豐度比例分別為21.70%、7.56%、5.24%和4.15%.
門、科、屬水平上的微生物群落結(jié)構(gòu)分析(Analyse)表明, 在高濃度CIP的長期脅迫和選擇性壓力下, 敏感性微生物活性受到抑制而難以生存; 而變形菌門中紅環(huán)菌科下的Methyloversatili
S、Ferruginibacter和動膠菌（fungus)屬及叢毛單胞菌科下的叢毛單胞菌屬最終成為了MBR中的優(yōu)勢菌屬.
2.1.2 CIP投加濃度對MBR中微生物群落多樣性的影響
考察CIP投加濃度對MBR中微生物群落豐富度與多樣性的影響, 結(jié)果如表 2所示.Chao1和ACE指數(shù)用來估計微生物群落的豐富度, 而Simpson和Shannon指數(shù)代表群落多樣性.由表 2可知, 隨著MBR進(jìn)水中CIP投加濃度的增加和反應(yīng)時間的延長, Chao1指數(shù)呈下降趨勢, 從0 mg ?L-1的1271.7降至15 mg ?L-1的469.7, 下降率為63%;ACE指數(shù)在整個運行中比較波動, 但整體上呈下降趨勢; Simpson指數(shù)持續(xù)升高, 而Shannon指數(shù)持續(xù)降低.Chao1、AC
E、Shannon指數(shù)的降低和Simpson指數(shù)的升高表明了MBR污泥中微生物群落受到了CIP的抑制導(dǎo)致部分微生物難以生存而死亡, 使得污泥中微生物群落豐富度和多樣性均呈下降趨勢, 這與圖 2顯示的結(jié)果一致.
表 2 CIP投加濃度對微生物(Micro-Organism)群落Chao1、AC
E、Simpson和Shannon指數(shù)的影響
2.1.3 CIP投加濃度對部分功能微生物群落的影響
考察CIP投加濃度對TO
C、氨氮和CIP去除效果的影響, 淺析污染物去除率變化與微生物群落結(jié)構(gòu)變化的關(guān)系.結(jié)合圖 5和圖 6可知, 隨著CIP投加濃度從0 mg ?L-1增加到15 mg ?L-1, TOC平均去除率從97.56%下降至90.84%, 表明CIP對有機物去除有所影響但影響程度不大.眾所周知, 菌膠團(tuán)是活性污泥和生物膜的重要組成部分, 是有機物降解去除的主力軍; 動膠菌屬作為菌膠團(tuán)的主要構(gòu)成體, 在CIP長期脅迫下, 其相對豐度比例趨于穩(wěn)定, 或許TOC去除效果較穩(wěn)定就與之相關(guān).
圖 6
圖 6 CIP投加濃度對污染物去除率的影響
圖 5顯示, 叢毛單胞菌屬也逐漸成為MBR中優(yōu)勢菌屬之一, 有研究報道該菌屬能利用CIP作為碳源[32]; 但在整個運行期間CIP去除率較低, 除了5 mg ?L-1時主要靠污泥吸附去除59.03%的CIP外, 其余時段平均去除率僅為7.24%~24.90%, 表明大部分優(yōu)勢菌種雖可在CIP脅迫下生存和繁殖, 但對CIP利用率不高.
由圖 6和圖 7可知, 隨著CIP投加濃度的增加和運行時間的延長, 亞硝化單胞菌屬和硝化螺旋菌屬相對豐度呈先降低后升高再降低的趨勢; 產(chǎn)堿菌屬和硝化桿菌屬持續(xù)減少, 最后消失.這4種菌屬的減少或消失對MBR中氨氮的篩除造成了負(fù)面影響, 平均去除率由0 mg ?L-1的96.67%降低至15 mg ?L-1的66.52%.雖然硝化微生物對低濃度CIP可能具有一定的抵抗性和適應(yīng)性, 但在高濃度CIP環(huán)境中硝化微生物卻很難成為優(yōu)勢菌群, 導(dǎo)致(cause)氨氮的去除效率降低.
圖 7
圖 7 CIP投加濃度對硝化菌屬的影響
2.2 CIP對抗性基因的影響
由圖 3~5可知, 在CIP投加濃度為5 mg ?L-1的階段, MBR中微生物在門、科和屬水平上的優(yōu)勢群落結(jié)構(gòu)分布均存在顯著（striking）性差異.因此選取該階段為研究對象, 考察CIP-ARGs平均相對豐度隨時間的變化情況, 判斷ARGs水平是否也存在類似現(xiàn)象, 結(jié)果如表 3所示.本研究選取的抗性基因包括DNA促旋酶A亞單位與B亞單位和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ的C亞單位與E亞單位.為了最大化減少分析檢測過程中產(chǎn)生的誤差, 采用CIP-ARGs的相對豐度進(jìn)行分析.表 3顯示, CIP的加入對MBR微生物產(chǎn)生了較為顯著的影響, 其中內(nèi)參基因16S rRNA的絕對豐度隨CIP暴露時間的增加總體上呈降低趨勢, 由3.45×107 copies ?g-1降至33 d的1.68×107 copies ?g-1; 4種CIP-ARGs在運行3 d時, 相對豐度均呈現(xiàn)不同程度的降低, 以gyrA基因降低幅度最大, 原因可能是攜帶這4種抗性基因的部分菌種對高濃度CIP敏感而被殺死.之后隨著運行時間的增加, 這4種CIP-ARGs的相對豐度呈波動狀態(tài), 但相較于CIP投加初期均有所增加, 原因可能在于細(xì)菌長期暴露在CIP環(huán)境中, 其DNA旋轉(zhuǎn)酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅳ基因的抗性決定區(qū)發(fā)生基因突變導(dǎo)致細(xì)菌對CIP出現(xiàn)抗性作用, 抗藥性細(xì)菌可能會逐漸被選擇成為優(yōu)勢菌群, 這與微生物群落結(jié)構(gòu)分布結(jié)果相一致.
表 3 CIP-ARGs在MBR運行中的波動變化
3 結(jié)論
通過(tōng guò)考察不同CIP投加濃度下MBR污泥中微生物(Micro-Organism)群落結(jié)構(gòu)變化發(fā)現(xiàn), 隨著CIP投加濃度和運行時間的增加, 工況4末, 門水平上Proteobacteria和Bacteroidetes仍然為MBR中的優(yōu)勢（解釋:能壓倒對方的有利形勢)菌群, 科水平上Rhodocyclacea
E、Chitinophagaceae和Comamonadaceae被選擇成為優(yōu)勢菌科, 屬水平上Methyloversatili
S、Ferruginibacte
R、Zoogloea和Comamonas被選擇成為優(yōu)勢菌屬.Chao1、AC
E、Shannon指數(shù)降低和Simpson指數(shù)升高表明MBR中微生物豐富度和多樣性均降低.高濃度CIP對硝化微生物Nitrosomona
S、Nitrospir
A、Alcaligenes和Nitrobacter的活性具有抑制作用, 導(dǎo)致氨氮去除效果下降.
CIP-ARGs分析表明高濃度CIP的長期脅迫使得MBR中的gyr
A、gyrB和parC基因增加.
本研究僅為CIP對MBR中微生物群落結(jié)構(gòu)特征和抗性基因的影響提供數(shù)據(jù)支撐,
